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Base de données et Banque nationale de spécimens biologiques aquatiques du Canada

Les scientifiques d’Environnement Canada prélèvent des échantillons de poissons pour la banque de spécimens en chalutant sur les Grands Lacs à bord du NGC Shark | Photo : Melanie Neilson (EC)Environnement Canada fait la collecte d’échantillons biologiques dans un certain nombre de lacs et de rivières au Canada dans le cadre de programmes du gouvernement fédéral. Depuis 1977, Environnement Canada a recueilli des poissons et des invertébrés dans les Grands Lacs conformément à l’ Accord relatif à la qualité de l'eau dans les Grands Lacs (AQEGL) Plus récemment, des échantillons ont été prélevés à l’échelle nationale en appui au Plan canadien de gestion des produits chimiques et au Programme de réglementation de la qualité de l'air. Environnement Canada conserve également une banque de tissus congelés de spécimens afin de répondre aux exigences de l’AQEGL. Cette activité fait partie intégrante des programmes de surveillance et de recherche du Ministère. La Banque nationale de spécimens biologiques aquatiques (BNSBA) se trouve dans une installation spécialisée du Centre canadien des eaux intérieures, à Burlington (Ontario). La BNSBA compte plus de 37 000 échantillons de poissons et d’invertébrés, recueillis dans le cadre de plus de 30 ans de surveillance environnementale au Canada. Les recherches qui ont été menées à partir d’échantillons de la BNSBA ont donné lieu à la rédaction de plus de 60 publications scientifiques, rapports et chapitres de livres.

Collecte de spécimens

  • Spécimens de truite marqués pour traitement qui seront ajoutés à la collection | Photo : Michael Keir (EC)Les principaux poissons visés pour la collection sont les grandes espèces de prédateurs de niveau trophique supérieur comme le touladi (Salvelinus namaycush), le doré jaune (Sander vitreus) et le grand corégone(Coregonus clupeaformis).
  • Les espèces de poisson fourrage visées pour la collection varient selon le plan d’eau. Dans les Grands Lacs, il s’agit habituellement du gaspareau (Alosa pseudoharengus), de l’éperlan (Osmerus mordax) et du chabot visqueux (Cottus cognatus).
  • Le plancton (>153 µm) et deux éléments clés du réseau trophique profond (Mysis relicta et Diporeia hoyi) sont également visés pour la collection sur les sites de prélèvement dans les Grands Lacs.
Résumé de la collection actuelle de la Banque nationale de spécimens biologiques aquatiques - Janvier 2012
Nom famille Nom scientifique Nom commune No. de spécimens No. de sous-échantillons
Poissons
Acipenseridae Acipenser fulvescens esturgeon jaune 8 33
Anguillidae Anguilla rostrata anguille d'Amérique 95 690
Anguillidae Anguilla anguilla anguille d'Europe 9 106
Catostomidae Catostomus commersonii meunier noir 213 1845
Catostomidae Catostomus cotostomus meunier rouge 20 71
Centrarchidae Micropterus dolomieu achigan à petite bouche 87 929
Centrarchidae Micropterus salmoides achigan à grande bouche 1 4
Clupeidae Alosa pseudoharengus gaspareau 454 785
Clupeidae Dorosoma cepedianum alose à gésier 35 180
Cottidae Cottus aper chabot épineux 14 23
Cottidae Cottus cognatus chabot visqueux 411 783
Cottidae Cottus ricei chabot à tête plate 10 33
Cottidae Myoxocephalus thompsonii chabot de profondeur 226 474
Cyprinidae Couesius plumbeus méné de lac 21 53
Cyprinidae Cyprinus carpio carpe commune 101 474
Cyprinidae Luxilus cornutus méné à nageoires rouges 22 50
Cyprinidae Notemigonus crysoleucas méné jaune 3 5
Cyprinidae Notropus atherinoides méné émeraude 52 133
Cyprinidae Notropis hudsonius queue à tache noire 4 4
Cyprinidae Phoxinus eos ventre rouge du Nord 4 4
Cyprinidae Rhinichthys cataractae naseux des rapides 1 1
Cyprinidae Semotilus atromaculatus mulet à cornes 3 4
Esocidae Esox lucius grand brochet 245 2726
Esocidae Esox masquinongy maskinongé  3 41
Esocidae Esox niger brochet maillé 53 408
Gadidae Lota lota lotte 269 778
Gasterosteidae Gasterosteus aculeatus aculeatus épinoche à trois épines 4 7
Gobiidae Neogobius melanostomus gobie à taches noires 162 411
Hiodontidae Hiodon alosoides laquaiche aux yeux d’or 2 2
Hiodontidae Hiodon tergisus laquaiche argentée  15 46
Ictaluridae Ameiurus nebulosus barbotte 43 178
Ictaluridae Ictalurus punctatus barbue de rivière 129 978
Moronidae Morone americana baret 88 266
Moronidae Morone chrysops bar blanc 9 9
Osmeridae Osmerus mordax éperlan 1009 1689
Percidae Etheostoma blennoides dard vert 6 6
Percidae Perca flavescens perchaude 310 709
Percidae Sander vitreus doré jaune 2368 9919
Percidae Stizostedion canadense doré noir 29 141
Percopsidae Percopsis omiscomaycus omisco 24 66
Petromyzontidae Petromyzon marinus lamproie 190 313
Salmonidae Coregonus spp. cisco 235 643
Salmonidae Coregonus clupeaformis grand corégone 589 2049
Salmonidae Coregonus hoyi cisco de fumage 69 176
Salmonidae Oncorhynchus clarki clarki truite fardée 61 221
Salmonidae Oncorhynchus gorbuscha saumon rose 32 32
Salmonidae Oncorhynchus kisutch saumon coho 364 441
Salmonidae Oncorhynchus mykiss truite arc-en-ciel 189 447
Salmonidae Oncorhynchus tshawytscha saumon quinnat 2 2
Salmonidae Prosopium coulterii ménomini pygmée 5 20
Salmonidae Prosopium cylindraceum ménomini rond 85 255
Salmonidae Prosopium williamsonii ménomini de montagnes 11 125
Salmonidae Salmo trutta truite brune 7 8
Salmonidae Salvelinus fontinalis omble de fontaine 189 529
Salmonidae Salvelinus fontinalis X namaycush truite moulac 307 411
Salmonidae Salvelinus namaycush touladi 11214 48916
Sciaenidae Aplodinotus grunniens malachigan 145 649
Invertébrés
Pontoporeiidae Diporeia hoyi diporeia 695 705
Mysidae Mysis relicta mysis 827 872
    plancton (153µm) 966 1040
    Autres invertébrés 110 116
TOTAL
  12855 83025

Conditions de stockage

Chaque spécimen est homogénéisé et divisé en 5 à 15 sous-échantillons de ~20 g. Tous les échantillons sont stockés à une température de -80 °C dans un bâtiment spécialisé à température contrôlée, où la sécurité et les conditions de stockage sont surveillés continuellement. En cas de panne d’électricité dans le bâtiment, le courant est assuré par des génératrices auxiliaires. En cas de défaillance mécanique d’un des congélateurs, les thermosondes déclencheront la libération de COliquide pour maintenir la température du congélateur jusqu’à ce que les spécimens soient transférés manuellement dans un autre congélateur.

Gestion de l’information

Tous les renseignements liés à la BNSBA sont conservés dans une base de données relationnelles sécurisée. Tous les spécimens reçus et/ou recueillis sont enregistrés et portent des numéros d’identification uniques et successifs. La base de données contient toutes les données biologiques (longueur, âge, etc.) associées à chaque numéro de spécimen ainsi que des données relatives à l’emplacement, aux méthodes de collecte utilisées, à l’entreposage et aux résultats de toutes les analyses chimiques effectuées sur le spécimen. Nous travaillons constamment à l’amélioration de la base de données afin d’accroître sa fonctionnalité et l’accès aux données qu’elle contient.

Accès aux spécimens

Les échantillons de tissu contenus dans la BNSBA peuvent être utilisés dans les projets de recherche en collaboration. La remise de spécimens à des fins de recherche doit respecter la politique d’Environnement Canada, laquelle est fondée sur les principes généraux suivants :

  • Le mérite scientifique de la recherche proposée a été évalué
  • Suffisamment de tissu peut être remis sans détruire indûment tout le spécimen.  Si une demande vise l’utilisation du tissu restant, elle devra être très bien justifiée
  • Après vérification, il n’existe aucune autre façon d’obtenir les renseignements requis
  • Les publications découlant de la recherche seront cosignées et comprendront des remerciements à la BNSBA

Pour de plus amples renseignements sur la façon de demander des échantillons et/ou des données de la BNSBA, veuillez écrire à NABSB@ec.gc.ca.

La science et la technologie au service des Canadiens - Banques nationales de spécimens de l'environnement d'Environnement Canada : Suivre un sentier chimique à partir du passé