Ébauche du rapport d'évaluation préalable concernant les organismes suivants :

nitrobacter winogradskyi (ATCC 25391),
espèce nitrobacter (18132-6),
espèce nitrobacter (16969-4),
nitrosomonas europaea (ATCC 25978),
espèce nitrosomonas (16968-3),
espèce nitrosomonas (18133-7),
rhodopseudomonas palustris (ATCC 17001),
espèce rhodopseudomonas (18136-1)


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Table des matières

Conformément à l'alinéa 74b) de la Loi canadienne sur la protection de l'environnement(1999) [LCPE (1999)], les ministres de l'Environnement et de la Santé ont effectué une évaluation préalable de huit souches de micro-organismes présentant un risque plus faible (priorité C). Ces souches ont été désignées et ajoutées à la Liste intérieure des substances, parce qu'elles ont été fabriquées ou importées au Canada entre le 1er janvier 1984 et le 31 décembre 1986, et elles ont pénétré ou ont été rejetées dans l’environnement sans être assujetties à la LCPE (1999) ou à toute autre loi fédérale ou provinciale.

Les organismes vivants inscrits sur la Liste intérieure des substances ont été classés en trois groupes (A, B, C) d'après les caractéristiques connues relatives au danger. Les 27 micro-organismes inscrits dans le groupe prioritaire C (faible danger) sont évalués à l'aide d'une approche accélérée parallèlement à l'évaluation plus complexe des 13 micro-organismes présents dans le groupe prioritaire A (danger élevé) avec l'objectif d'évaluer plus efficacement la totalité des micro-organismes inscrits sur la Liste intérieure des substances et de fournir une plus grande certitude aux industries qui utilisent ces micro-organismes. Le groupe prioritaire C a été ensuite divisé en quatre « lots » aux fins d'évaluation en fonction de leur classification taxinomique (genre ou espèce) et de leurs utilisations connues et potentielles liées à leurs propriétés biologiques et d'après la confirmation que les micro-organismes restent commercialisés ou non au Canada. Le présent avis s'applique au lot 1 du groupe prioritaire C. Pour obtenir plus de renseignements, veuillez consulter le document Établissement des priorités concernant les micro-organismes inscrits sur la Liste intérieure des substances avant leur évaluation préalable en vertu de l’article 74 de la LCPE (1999).

Tableau 1. Liste des micro-organismes dans le lot 1 du groupe prioritaire C

OrganismeNuméro d'accès ou de la souche
Nitrobacter winogradskyiATCC 25391
Espèce nitrobacter18132-6
Espèce nitrobacter16969-4
Nitrosomonas europaeaATCC 25978
Espèce nitrosomonas16968-3
Espèce nitrosomonas18133-7
Rhodopseudomonas palustrisATCC 17001
Espèce rhodopseudomonas18136-1

Lorsque les données propres à une souche n'étaient pas disponibles, des données de substitution provenant de recherches documentaires ont été utilisées. Les organismes de substitution sont identifiés dans chaque cas au niveau taxinomique fourni par la source. Les renseignements déterminés jusqu'à janvier 2012 ont été pris en compte afin d'être inclus dans le rapport d'évaluation préalable.

Cette évaluation préalable a été préparée par le personnel des sections de biotechnologies de Santé Canada et d'Environnement Canada. Les portions sur la santé humaine et sur l’écologie de l’évaluation des espèce nitrobacter ont subi une évaluation écrite par Peter Bottomley (Université de l’Orégon), un scientifique extérieur du gouvernement qui possède une expertise dans ce domaine.

Évaluation du danger

Les huit micro-organismes dans le lot 1 sont des bactéries d'origine naturelle. Aucun n'est reconnu comme étant un agent pathogène humain par l'Agence de santé publique du Canada et aucun effet nocif sur la santé humaine n'est associé à ces souches, à leur matériel biologique, à leurs métabolites secondaires ou à leurs composantes structurelles. De même, aucune de ces souches n'est reconnue comme étant un agent pathogène des animaux ou des végétaux par l'Agence canadienne d'inspection des aliments ou par tout pays membre de la Convention internationale pour la protection des végétaux. De plus, selon une recherche documentaire scientifique approfondie, on n'a constaté aucune présence de facteurs de virulence ou preuve de toxicité ou de pathogénicité pour les humains, les végétaux, les vertébrés ou les invertébrés. Ces observations sont appuyées par un séquençage génomique et une analyse de ces souches (Starkenburg et al., 2006; Chain et al., 2003; Larimer et al., 2004). Dans le cas peu probable d'une infection, toutes les souches du lot 1 sont sensibles aux antibiotiques pertinents d'un point de vue clinique.

Le potentiel de risque associé aux micro-organismes présents dans le lot 1 a été estimé faible tant pour l'environnement que pour la santé humaine.

Évaluation de l'exposition

Les souches des huit micro-organismes du lot 1 sont présentes dans une variété de milieux naturels, mais on ne dispose que de très peu de renseignements ou de données sur le niveau d'exposition dans ces milieux. L'évaluation de l'exposition vise à caractériser l'exposition humaine et environnementale à ces huit souches qui est provoquée par leur utilisation délibérée dans les produits de consommation et industriels utilisés au Canada.

Les données sur l'exposition associée aux souches des huit micro-organismes dans le lot 1 ont été rassemblées à partir de sources accessibles au public et par l'intermédiaire d'un sondage relatif à la collecte obligatoire de renseignements (avis) en vertu de l'article 71 de la LCPE (1999) publié dans la Gazette du Canada le 3 octobre 2009. D'après les réponses à ce sondage, les souches du lot 1 sont utilisées dans des quantités allant de 50 à 200 kg par an en tant qu'ingrédients ajoutés aux produits commerciaux et de consommation. Aucun renseignement sur l'espèce nitrobacter (18132-6), l'espèce nitrosomonas (18133-7), ou l'espèce rhodopseudomonas (18136-1) n'a été recueilli par le biais de l'avis, car elles ont été inscrites sur la Liste intérieure des substances une fois que le sondage a eu lieu.

Les utilisations actuelles et potentielles des micro-organismes du lot 1 se font sous forme d'ingrédients dans les produits microbiens employés pour la biorémédiation, le traitement biologique des déchets et le traitement des eaux usées municipales; ils sont également utilisés pour nettoyer les tuyaux d'écoulement et les bacs à graisse dans les restaurants et pour améliorer la qualité de l'eau dans les installations commerciales et de production piscicole récréative, et bien plus. Leur mode d'action est basé sur leur capacité à dégrader les déchets azotés, la graisse et les huiles, ainsi que les substances chimiques produites par l'homme présents dans les effluents (composés halogénés et aromatiques et ingrédients pharmaceutiques actifs).

L'exposition humaine devrait avoir lieu principalement par l'intermédiaire d'un contact direct avec les produits de consommation et commerciaux contenant ces micro-organismes. Par exemple, pendant l'application de produits ménagers contenant ces souches, une exposition par voie cutanée ainsi qu'une inhalation de gouttelettes ou de particules pulvérisées contenant ces micro-organismes est probable. Un contact avec les yeux et une ingestion accidentelle se produisant à la suite d'une contamination des mains et des surfaces de préparation des aliments peuvent également se produire. Les utilisations prévues et potentielles sont susceptibles de faire pénétrer ces micro-organismes dans le sol et l'eau. L'exposition humaine qui a lieu par l'intermédiaire de l'eau traitée, des effluents d'eaux usées ou des sites de biorémédiation ne devrait pas être importante, mais la flore et la faune environnementale peuvent entrer en contact avec ces micro-organismes lorsqu'ils sont rejetés par des activités commerciales, industrielles ou de fabrication.

Il n'existe que très peu de renseignements sur les concentrations de fond des micro-organismes du lot 1 ou sur leur persistance dans l'environnement. La présence de l'organisme nitrobacter winogradskyi a été signalée dans le sol à des concentrations de 104 - 105 cellules par grammes(Rennie and Schmidt, 1977), ce qui correspond à la nature de l'organisme nitrobacter winogradskyi dont la croissance est lente et la culture difficile; c'est aussi un organisme qui diminue rapidement lorsqu'il est introduit dans des milieux qui n'offrent pas des conditions de croissance idéales. On n'a trouvé aucune mesure liée aux concentrations de l'espèce nitrosomonas europaea dans les sols naturels; cependant, les organismes oxydants à l'ammoniac sont, selon les estimations, présents à des concentrations allant de 105 à 106 organismes/cm3 (Lang and Elliott, 1997). Les organismes oxydants à l'ammoniac sont capables de survivre pendant des périodes de dessiccation (jusqu'à 10 semaines) grâce à la formation d'une capsule polysaccharidique (Allison and Prosser, 1991). On ne dispose d'aucune information ou donnée sur la survie ou la persistance des populations de rhodopseudomonas palustris. D'après les renseignements et les données disponibles, les souches du lot 1 ne devraient pas persister dans l'environnement à des concentrations supérieures aux niveaux de fond.

Étant donné la portée des applications potentielles impliquant ces micro-organismes, ainsi que les tendances de marché tournées vers une utilisation accrue de produits microbiens en remplacement des produits chimiques dans certains secteurs, l'ampleur et la fréquence de l'utilisation de ces souches devraient augmenter avec des rejets par conséquent plus élevés dans l'environnement. Des hypothèses prudentes ont donc été appliquées à la caractérisation de l'exposition.

Par conséquent, l'exposition associée au micro-organisme du lot 1 a été estimée modérée tant pour l'environnement que pour la santé humaine.

Évaluation des risques

Il n'est pas reconnu que les huit souches causent des maladies et les voies d'exposition ne devraient pas entraîner d'effets nocifs pour l'environnement ou la santé humaine.

En raison du manque d'éléments probants documentés concernant les effets nocifs liés à ces souches malgré leur ubiquité dans la nature et en tenant compte des nombreuses utilisations prévues et potentielles, le risque estimé occasionné par l'exposition humaine et environnementale due aux utilisations connues et potentielles devrait être faible aussi bien pour l'environnement que pour la santé humaine.

Conclusion proposée

D'après les renseignements disponibles, les substances de cette évaluation ne pénètrent pas dans l'environnement en une quantité, à une concentration ou dans des conditions de nature à avoir, immédiatement ou à long terme, un effet nocif sur l'environnement ou sur la diversité biologique, ou à mettre en danger l'environnement essentiel pour la vie, ou à constituer un danger au Canada pour la vie ou la santé humaine. Il est donc proposé que ces substances ne satisfont à aucun des critères énoncés à l’article 64 de la LCPE (1999).

D'autres renseignements sur l'approche d'évaluation concernant les micro-organismes présentant un danger faible inscrits sur la Liste intérieure sont disponibles sur le site Web des Substances chimiques du gouvernement du Canada.

Références

Allison,S.M. et Prosser,J.I. (1991). Survival of ammonia oxidising bacteria in air-dried soil. FEMS Microbiol. Lett. 79, 65-68.

Chain,P., Lamerdin,J., Larimer,F., Regala,W., Lao,V., Land,M., Hauser,L., Hooper,A., Klotz,M., Norton,J., Sayavedra-Soto,L., Arciero,D., Hommes,N., Whittaker,M., et Arp,D. (2003). Complete Genome Sequence of the Ammonia-Oxidizing Bacterium and Obligate Chemolithoautotroph Nitrosomonas europaea. J. Bacteriol. 185, 2759-2773.

Lang,H.J. et Elliott,G.C. (1997). Enumeration and inoculation of nitrifying bacteria in soilless potting media. J. Amer. Soc. Horticult. Sci. 122, 709-714.

Larimer,F.W., Chain,P., Hauser,L., Lamerdin,J., Malfatti,S., Do,L., Land,M.L., Pelletier,D.A., Beatty,J.T., Lang,A.S., Tabita,F.R., Gibson,J.L., Hanson,T.E., Bobst,C., Torres,J.L., Peres,C., Harrison,F.H., Gibson,J., et Harwood,C.S. (2004). Complete genome sequence of the metabolically versatile photosynthetic bacterium Rhodopseudomonas palustris. Nat. Biotechnol. 22, 55-61.

Rennie,R.J. et Schmidt,E.L. (1977). Autecological and kinetic analysis of competition between strains of Nitrobacter in soils. Ecological Bulletins (Stockholm) 431-441.

Starkenburg,S.R., Chain,P.S.G., Sayavedra-Soto,L.A., Hauser,L., Land,M.L., Larimer,F.W., Malfatti,S.A., Klotz,M.G., Bottomley,P.J., Arp,D.J., et Hickey,W.J. (2006). Genome sequence of the chemolithoautotrophic nitrite-oxidizing bacterium Nitrobacter winogradskyi Nb-255. Appl. Environ. Microbiol. 72, 2050-2063.